케이알랩바이오
유전자 분석 서비스
Next Generation Sequencing
16S metagenome Sequencing
![white molecule or atom, Abstract Clean structure for Science or white molecule or atom, Abstract Clean structure for Science or medical background, 3d illustration.](https://www.krlab.bio/wp-content/uploads/elementor/thumbs/white-molecule-or-atom-abstract-clean-structure-for-science-or-medical-background-pypfcioel6ofhfoe4ehohaeymwiki8g9e3ucyg2lxk.jpg)
특정 환경샘플에서 얻어진 세균총 분석을 위해 16s RNA유전자 정보에 주목하여 세균 군집을 포괄적으로 분석함으로써 각 환경의 미생물 군집의 패턴 차이 및 상호작용에 대해 확인할 수 있습니다.
최근 주목받고 있는 장내 미생물의 분포 및 관련된 임상 연구, 생명공학, 피부, 가축, 반려동물 등 다양한 분야에 metegenome sequencing을 적용하여 사용 할 수 있습니다.
Service Info. | Total RNA-seq |
Sample Requirement | >1~2 ug genomic DNA |
Library Method | V3-V4 region primer Ion 520™ & Ion 530TM ExT Kit |
NGS system | Ion GeneStudio S5 System, Ion S5™ XL System |
Turnaround Time | gDNA QC 통과 후 4주 정도 소요 |
* genomic DNA prep을 원할 경우 DNA prep 서비스 추가.
Data Analysis
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Operational Taxonomic Unit
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Clustering
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α-diversity
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β-diversity
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Differential abundance test
Ion AmpliSeq Transcriptome
![3D render of a medical DNA background 3D render of a medical background with DNA strands](https://www.krlab.bio/wp-content/uploads/elementor/thumbs/dna-closely-pypfbyxslnxepmh2bnyiixea5t7v0l9wbe55vmvvk8.jpg)
Human, mouse 샘플을 대상으로 Ion AmpliSeq Transcriptome Next- Generation Sequencing(NGS) 기술을 이용하여 2만 개 이상의 전체 유전자를 분석하여 유전자 단위로 발현 수준을 효율적으로 확인 할 수 있습니다.
Service Info. | Total RNA-seq |
Sample Requirement | >10ng total RNA |
Library Method | Ion AmpliSeq™ Transcriptome Gene Expression Panel, Chef-Ready Kit. |
NGS system | Ion GeneStudio S5 System, Ion S5™ XL System |
Number of Genes | Human : 20,802 Ref.Seq genes Mouse : over 20,000 Ref.Seq genes |
Turnaround Time | RNA QC 통과 후 4주 정도 소요 |
Sample Type | Tissue, cell, whole blood etc. |
* RNA prep을 원할 경우 RNA prep 서비스 추가.
Data Analysis
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Differentially Expressed Genes (DEGs)
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Gene Ontology (GO) analysis
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KEGG pathway enrichment analysis
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Clustering
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Network
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Gene Set Enrichment Analysis (GESA)
Total RNA-Seq
![A network of molecules and atoms of glass and crystals constitute a single system. 3D illustration A network of molecules and atoms of glass and crystals constitute a single system. 3D illustration](https://www.krlab.bio/wp-content/uploads/elementor/thumbs/a-network-of-molecules-and-atoms-of-glass-and-crystals-pypfbolkihj95ww301hm9i07mkmtnx4ulyytllb7go.jpg)
RNA를 분리하여 NGS 기술을 통해 전사체 (transcriptome) 분석을 수행해드립니다.
Coding RNA, 다양한 형태의 non-coding RNA를 모두 분석합니다.
Phenotype에 대해 포괄적인 분석이 가능하기 때문에 광범위한 전사체에서 biomarker를 확인할 수 있습니다.
Service Info. | Total RNA-seq |
Sample Requirement | >1ug total RNA |
Library Method | rRNA Depletion +Ion Total RNA-Seq Kit v2 +Ion Xpress RNA-Seq Barcode 1-16 Kit |
NGS system | Ion S5 System |
Turnaround Time | RNA QC 통과 후 4주 정도 소요 |
Sample Type | Tissue, cell, whole blood , plant, fungi etc. |
* RNA prep을 원할 경우 RNA prep 서비스 추가.
Data Analysis
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Gene fusion
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RNA-Seq Differential Expression
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variant analysis
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Clustering
mRNA-Seq
![Cosmetic Essence oil Liquid Bubble with molecule on Dna backgrou Cosmetic Essence oil Liquid Bubble with molecule on Dna background, 3d rendering.](https://www.krlab.bio/wp-content/uploads/elementor/thumbs/cosmetic-essence-oil-liquid-bubble-with-molecule-on-dna-background-3d-rendering-pypfbw4a15tjqsl5s4qmtg3wdnlrdhypb06pft022w.jpg)
RNA를 분리하여 NGS 기술을 통해 전사체 (transcriptome) 분석을 수행해드립니다.
대립유전자 특이적 발현(allele-specific expression)과 새로운 transcript isoforms, gene fusions 및 기타 특징을 확인할 수 있습니다.
Service Info. | Total RNA-seq |
Sample Requirement | >1ug total RNA |
Library Method | Dynabeads® mRNA DIRECT™ Micro Purification Kit (Poly(A) RNA Selection) +Ion Total RNA-Seq Kit v2 +Ion Xpress RNA-Seq Barcode 1-16 Kit |
NGS system | Ion GeneStudio S5 System, Ion S5™ XL System |
Turnaround Time | RNA QC 통과 후 4주 정도 소요 |
Sample Type | Tissue, cell, whole blood , plant, fungi etc. |
* RNA prep을 원할 경우 RNA prep 서비스 추가.
Data Analysis
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Gene fusion
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RNA-Seq Differential Expression
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Clustering