케이알랩바이오

bioinformatics

서비스 소개

데이터는 나왔는데  시각화를 어떻게 해야 할지 막막하신가요?
저희 케이알랩바이오와 함께 해보세요.
Python, R 프로그래밍, 통계를 바탕으로 전문적인 Bioinformatics 분석을 제공합니다.
또한 전문가와의 상담을 통해 논문과 보고서에 사용할 수 있도록 최선을 다해 도와드리겠습니다.

데이터 분석 및 시각화

Python과 R 을 기반으로 한 데이터 분석 및 시각화
원하는 옵션에 맞춘 그래프 제작
자세한 내용은 아래의 링크를 통하여 BI 안내서를 확인해주세요!

240621_연구소용 BI안내서_일반연구소용(링크)

240621_케이알랩바이오 WGS 안내서(링크)

서비스 제공절차

1. 상담 및  분석가능여부 확인
2. 데이터 및 가설 전달 (참고 논문이 있으면 더 좋습니다.)
3. 분석 방향 협의
4. 결과  제공 및 수정
5. 필요시 추가 수정

분석 전 준비사항

1. 데이터 파일 및 관련 설명
2. 명확한 요구사항 또는 관련논문

항목

1. V3-V4 Metagenome

[기본분석]

  • OTU (Operational Taxonomic Units) Table, Sample Total reads
  •  Rarefaction curve, Stacked bar plot
  •  Alpha Diversity, Beta Diversity(PCoA)

[심화 분석]

  • Alpha Diversity, Beta Diversity심화(pvalue 계산 등)
  • Heatmap
  • LEfSe, Random Forest
  • ANCOM, ALDEx2
  • ANOSIM

2. WGS (De Novo)

[기본분석]

  • Data Filtering and Quality Control
  • De novo assembly
  • Genome annotation

[심화 분석]

  • NCBI Blast
  • Phylogenetic Tree
  • MLST (Multilocus Sequence Typing)

3. WGS(Reference Sequencing)

[기본분석]

  • Data Filtering and Quality Control
  • Reference mapping
  • Genome annotation

[심화 분석]

  • NCBI Blast
  • Phylogenetic Tree
  • MLST (Multilocus Sequence Typing)
  • SNP(Single Nucleotide Polymorphism)
  • CNV(Copy Number Variation)
  • Variant Annotation
  • Genomic Data Visualization

4. 비교 유전체학 분석 (WGS 데이터로 진행)

[심화 분석]

  • Geographical distribution
  • MST(Minimum Spanning Tree)
  • Phylogenetic
  • Time-based tree
  • Heatmap
  • HGT (Horizontal Gene Transfer)

분석 사례 예시

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안내사항

[주의사항]

정확한 가격 산정을 위해 문의 후 분석요청을 주시기 바랍니다. (support@krlab.bio / 02-468-2201) 위의 안내사항에 기재되어 있지 않은 분석에 대해서는 추가 문의 부탁드립니다.


[수정 및 재분석]

기본적인 수정(그래프의 점 크기, 선 등) 및 데이터 오류 수정 각 서비스에 해당하는 횟수만큼 진행되며 그   이상 혹은 대폭 수정이 필요한 경우(그래프 변경, 데이터 변경, 가설 변경)에는 추가 결제가 필요합니다.

제공사항

  기본분석 심화분석
결과해석 제공 제공
그래프/차트 1개 1개
분석 1개 1개
수정횟수 2회 5회
작업일 2일 2주 이내